Thông thường khi nước lũ đổ về từ thượng nguồn sẽ cuốn trôi phèn, chất hữu cơ, độc tố thuốc bảo vệ thực vật về hạ nguồn theo các con sông, kênh rạch mà dân gian hay gọi là nước cỏ, nước son. Dòng nước này rất độc đối với các loài thủy sản nuôi nên có thể trực tiếp gây ảnh hưởng lên cá nuôi bè hay gián tiếp ảnh hưởng lên cá nuôi ao thông qua hoạt động lấy nước, thay nước. Lũ về cũng khiến cho mực nước trong các vùng nội đồng dâng cao gây ra hiện tượng tràn bờ, phá bờ, nhất là tình trạng gây ra áp lực phèn lên ao nuôi tôm, cá khi nước lũ mới xuất hiện. Điều này làm cho tôm, cá nuôi trong ao, đầm của bà con nông dân bị thất thoát hoặc bị sốc môi trường dẫn đến tình trạng dễ bị dịch bệnh tấn công gây hao hụt nhiều.

Do đó, để hạn chế những thiệt hại có thể xảy ra, bà con nuôi cá cần nhanh chóng gia cố bờ ao, nếu có điều kiện đắp bờ ao cao hơn mực nước lũ hàng năm khoảng 0,3m. Đối với những hộ ương nuôi cá giống trên ruộng trong những khu vực có lũ hàng năm thì cần thu hoạch ngay để tránh thiệt hại, bởi các hoạt động gia cố bờ ao, thu giữ cá giống trong những khu vực này thường không có hiệu quả. Còn đối với những hộ trong vùng lũ có dự định ương cá giống thì cần đợi sau khi lũ rút mới tiến hành thả cá bột để ương nuôi.

Đối với những hộ nuôi cá thịt ngoài khu đê bao, nếu cá đạt kích cỡ thương phẩm và có giá tương đối thì cần tranh thủ thu hoạch ngay để tránh lũ. Trong trường hợp, cá chưa tới lứa thu hoạch hoặc giá cá thấp, bà con nuôi cá cần san, dồn cá vào ao có kích thướt nhỏ hơn để dễ quản lý. Tuy nhiên, bà con không nên dồn cá với mật độ quá cao, trong quá trình bắt cá cần thao tác nhẹ nhàng, tránh xây sát để không ảnh hưởng đến sức khỏe cá nuôi. Bờ ao cần gia cố chắc chắn, rào lưới chung quanh ao với độ cao lưới cao hơn 0,5m so với đỉnh lũ cao nhất của các năm trước.

Đối với những ao nuôi cá nằm trong khu đê bao, bà con nuôi cá cần gia cố kỹ bờ ao để tránh áp lực phèn từ ngoài rò rỉ vào ao gây biến động pH, rào lưới xung quanh ao với chiều cao lưới phải cao hơn bờ ao ít nhất 0,5m để tránh cá thất thoát do nước tràn bờ. Bên cạnh đó, cần đào rảnh xung quanh ao và rải vôi vào rảnh này (5-7kg/100m²) để ngăn không cho phèn bên ngoài tràn vào ao. Tiếp theo, bà con lấy vôi bột hòa với nước với liều 2-3 kg/100m³, rồi lấy nước vôi trong tạt đều khắp ao để nâng pH, lắng tụ các chất hữu cơ lơ lửng trong nước. Lưu ý, bà con cần hạn chế thay nước ao nuôi trong thời gian có lũ để không gây biến động môi trường nước trong ao nhằm tránh gây ảnh hưởng xấu đến cá nuôi.

 Đối với hoạt động nuôi cá lồng bè, bà con cần tranh thủ thu hoạch nếu cá đạt cỡ thương phẩm. Nếu cá chưa tới cỡ thu hoạch thì cần chăm sóc kỹ, cho ăn đầy đủ, đúng liều lượng với những loại thức ăn viên công nghiệp có chất lượng. Đồng thời tăng cường sức đề kháng cho cá trong “mùa nước son” bằng cách trộn Vitamin C vào thức ăn, thường xuyên theo dõi sức khỏe của cá để có biện pháp xử lý kịp thời. Bà con nuôi cá bè cần lưu ý không nên thả cá giống trong “mùa nước son” do môi trường nước xấu, tỷ lệ cá hao hụt sẽ rất cao. Rút kinh nghiệm để tránh lũ các năm sau, bà con ương nuôi cá vùng thường xuyên ngập lũ cần tính toán thời gian nuôi và lựa chọn đối tượng nuôi phù hợp để thu hoạch trước khi lũ về.